Αμφιλεγόμενη θέση πήρε το Βερολίνο σχετικά με τη χρήση της Αγίας Σοφίας ως τζαμιού. Ο εκπρόσωπος του γερμανικού υπουργείου Εξωτερικών Μάρτιν Σέφερ, όταν ρωτήθηκε από δημοσιογράφους για το θέμα της Αγίας Σοφίας και την ανάγνωση του κορανίου, απάντησε κυνικά ότι «η χρήση της Αγίας Σοφίας αποτελεί υπόθεση της Τουρκίας».
Στη συνέχεια, με πιο… διπλωματικό ύφος, είπε πως «η Αγία Σοφία είναι Μνημείο Παγκόσμιας Πολιτιστικής Κληρονομιάς της UNESCO και θα επιθυμούσαμε να υπάρχει μια χρήση η οποία δεν αγγίζει το καθεστώς της ως μνημείου».
Ωστόσο, πρόσθεσε ότι δεν έχει λόγο να αμφισβητήσει ότι η Τουρκία εφαρμόζει τις υποχρεώσεις που συνδέονται με το καθεστώς Μνημείου Παγκόσμιας Πολιτιστικής Κληρονομιάς της UNESCO, το οποίο απολαμβάνει η Αγία Σοφία. Απαντώντας σε ερώτηση αν θεωρεί τυχαίο το γεγονός ότι η Τουρκία επιλέγει τώρα να την χρησιμοποιήσει ως τζαμί, ο Μ. Σέφερ επισήμανε: «Η Αγία Σοφία έχει χρησιμοποιηθεί επί αιώνες ως τζαμί. Το τι πιστεύω δεν παίζει ρόλο, νομίζω. Και το τι πιστεύουν άλλοι σε αυτό το έδρανο [σ.σ.: των εκπροσώπων της κυβέρνησης] δεν παίζει ρόλο.
»Σαφή απάντηση μπορείτε να βρείτε ίσως με το να μην απευθύνετε το ερώτημα σ’ εμάς, αλλά σε αυτούς που έλαβαν τα μέτρα σχετικά με την Αγία Σοφία».