Σε δίκη για κακουργηματική απάτη παραπέμπεται ο γενικός διευθυντής του ΚΕΕΛΠΝΟ Θεόδωρος Παπαδημητρίου. Το Ποινικό Τμήμα του Αρείου Πάγου απέρριψε την αίτηση αναίρεσης της Εισαγγελίας του Ανωτάτου Δικαστηρίου κατά του σχετικού παραπεμπτικού βουλεύματος του Συμβουλίου Εφετών Αθηνών.
Στον Θ. Παπαδημητρίου αποδίδεται απάτη ύψους 568.022 ευρώ για τρεις περιπτώσεις οικονομικής διαχείρισης του ΚΕΕΛΠΝΟ. Η πρώτη περίπτωση αφορά την υπογραφή συμφωνητικού φύλαξης τριών κτηρίων για ένα έτος (2005-2006), η δεύτερη για υπόθεση επιδόματος αυξημένης αρμοδιότητας.
Η τρίτη αφορά την έγκριση δαπάνης ύψους 336.488 ευρώ η οποία δόθηκε ως αμοιβή σε γραφεία εμπιστευτικών ερευνών για την αντιμετώπιση περιστατικών βιοτρομοκρατίας κατά την διετία 2002-2003.
